1. 分子生物實驗室設(shè)計要求
分子生物實驗室并沒有嚴格的凈化等級要求,但是為避免各個實驗區(qū)域間交叉污染的可能性,宜采用全送全排的氣流組織形式。同時,要嚴格控制送、排風(fēng)的比例以保證各實驗區(qū)的壓力要求。
(1)試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)
該實驗區(qū)主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備。試劑和用于樣品制作的材料應(yīng)直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。對與氣流壓力的控制,本區(qū)應(yīng)對外界保持微正壓。
(2)標(biāo)本制備區(qū)
該區(qū)域主要進行的操作為樣本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應(yīng)管和測定DNA的合成。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應(yīng)避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動。
(3)PCR擴增區(qū)
該區(qū)域主要進行的操作為DNA擴增和擴增片段的測定。此外,已制備的DNA模板(來自樣本制備區(qū))的加入和主反應(yīng)混合液(來自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應(yīng)混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進行。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應(yīng)盡量減少在本區(qū)內(nèi)的不必要的走動。個別操作如加樣等應(yīng)在超凈臺內(nèi)進行。
(4)PCR產(chǎn)物分析區(qū),該區(qū)域主要用于PCR產(chǎn)物的電泳、成像及分析,也可以兼容下游測序、雜交等實驗。本實驗區(qū)內(nèi)樣本主要為高濃度PCR產(chǎn)物,氣溶膠濃度極高,污染風(fēng)險最大,應(yīng)嚴格保持負壓,并且獨立通風(fēng)。本實驗室所有實驗器具及人員實驗服需要與其他實驗室保持隔離,任何相關(guān)物品只進不出,實驗室中廢料也應(yīng)當(dāng)封存送出丟棄或清洗。為配合電泳需求,該實驗室必須配有獨立水源及水槽。
2. 分子生物實驗室設(shè)計圖范例
(1)常規(guī)4區(qū)PCR實驗室設(shè)計方案可見下圖:
該方案可以簡化為三間,將產(chǎn)物分析區(qū)取消,并在遠離此區(qū)域的另一件非分子生物實驗室中進行產(chǎn)物分析實驗。
(2)在實驗室分布條件不適合建立PCR實驗室的時候,可以嘗試將已有潔凈實驗室作為試劑準(zhǔn)備區(qū),已有開放實驗室作為樣本制備區(qū)和PCR擴增區(qū),并將遠離這兩個區(qū)域的有水槽和水源的非核酸實驗室內(nèi)安放電泳、成像等產(chǎn)物分析設(shè)備。
(3)在實驗室空間不富足的情況下也可以通過分割空間的方式以單間實驗室建立分子生物實驗室,并同樣在遠離此區(qū)域的另一件非分子生物實驗室中進行產(chǎn)物分析實驗。參考方案可見下圖:
單間實驗室分割方案1:
單間實驗室分割方案2:
儀器設(shè)備名稱 | 數(shù)量 | 放置區(qū)域 |
冰箱 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
渦旋混勻儀 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
臺式離心機 | 1 | 樣本制備區(qū) |
掌上離心機 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
紫外線消毒車 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
潔凈工作臺 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
移液器 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
移液器 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
移液器 | 1 | 樣本制備區(qū) |
移液器 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
移液器 | 1 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) |
紫外線消毒車 | 1 | 樣本制備區(qū) |
臺式離心機 | 1 | 樣本制備區(qū) |
掌上離心機 | 1 | 樣本制備區(qū) |
勻漿儀 | 1 | 樣本制備區(qū) |
總核酸OD濃度測定 | 1 | 樣本制備區(qū) |
冰箱 | 1 | 樣本制備區(qū) |
生物安全柜 | 1 | 樣本制備區(qū) |
渦旋混勻儀 | 1 | 樣本制備區(qū) |
PCR板封膜儀 | 1 | 樣本制備區(qū) |
96孔板離心機(可選) | 1 | 樣本制備區(qū) |
核酸提取儀(可選) | 1 | 樣本制備區(qū) |
金屬浴 | 1 | 樣本制備區(qū) |
水浴鍋 | 1 | 樣本制備區(qū) |
移液器 | 1 | 樣本制備區(qū) |
移液器 | 1 | 樣本制備區(qū) |
移液器 | 1 | 樣本制備區(qū) |
移液器 | 1 | 樣本制備區(qū) |
移液器 | 1 | 樣本制備區(qū) |
熒光定量PCR儀 | 1 | PCR擴增區(qū) |
普通PCR儀器 | 1 | PCR擴增區(qū) |
紫外線消毒車 | 1 | PCR擴增區(qū) |
移液器 | 1 | PCR擴增區(qū) |
移液器 | 1 | PCR擴增區(qū) |
移液器 | 1 | PCR擴增區(qū) |
移液器 | 1 | PCR擴增區(qū) |
凝膠成像儀 | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
電泳儀 | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
電泳槽 | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
脫色搖床(可選) | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
微波爐 | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
電子天平 | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
移液器 | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
移液器 | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
紫外線消毒車 | 1 | 產(chǎn)物分析區(qū) |
超純水 | 試劑準(zhǔn)備區(qū)&樣本制備區(qū) | |
PCR試劑盒 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) | |
PCR預(yù)混液 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) | |
96孔PCR板 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) | |
96孔板透明膜 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) | |
八聯(lián)管和管蓋 | 試劑準(zhǔn)備區(qū) | |
各式槍頭 | 試劑準(zhǔn)備區(qū)&樣本制備區(qū)&產(chǎn)物分析區(qū) | |
電泳專用槍頭(可選) | 產(chǎn)物分析區(qū) | |
EP管 | 試劑準(zhǔn)備區(qū)&樣本制備區(qū) | |
冰盒 | 試劑準(zhǔn)備區(qū)&樣本制備區(qū) |